Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms