Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms