Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms