Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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