Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmgn3Q9DCB1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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