Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms