Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms