Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx5Q9D8U8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx5Q9D8U8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx5Q9D8U8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms