Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Mrpl17Q9D8P4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mrpl17Q9D8P4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mrpl17Q9D8P4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Mrpl17Q9D8P4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mrpl17Q9D8P4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mrpl17Q9D8P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl17Q9D8P4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms