Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc39Q9D5Y1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms