Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms