Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms