Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc7Q9D541 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms