Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms