Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms