Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms