Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms