Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acsl3Q9CZW4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acsl3Q9CZW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms