Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PmpcbQ9CXT8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms