Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ist1Q9CX00 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ist1Q9CX00 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ist1Q9CX00 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ist1Q9CX00 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ist1Q9CX00 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ist1Q9CX00 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ist1Q9CX00 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms