Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms