Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms