Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms