Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CR55 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CR55 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CR55 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9CR55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CR55 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9CR55 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CR55 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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