Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tma16Q9CR02 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms