Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms