Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rwdd4Q9CPR1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rwdd4Q9CPR1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms