Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim8Q99PJ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms