Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930550L24RikQ99PA7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930550L24RikQ99PA7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms