Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup155Q99P88 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms