Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms