Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms