Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms