Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms