Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms