Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99KU6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99KU6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms