Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms