Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlcd1Q99JT6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms