Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms