Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnip2Q99JG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms