Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms