Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1dQ99246 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1dQ99246 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms