Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms