Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms