Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd3Q91W18 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms