Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhbdd2Q8VEK2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhbdd2Q8VEK2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms