Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul7Q8VE73 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms