Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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