Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fyco1Q8VDC1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fyco1Q8VDC1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms