Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4G9

Chrna3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna3Q8R4G9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna3Q8R4G9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms